扣人心弦的《血色星期二》第二部再次席卷而來。天才黑客高木藤丸(三浦春馬 飾)這次又會遇到什么棘手的問題呢?
第一部的最后,藤丸和其朋友力挽狂瀾地阻止了病毒危機。而這次他們面臨的則是更加令人恐怖的核彈恐怖計劃。在病毒危機結束后兩年,受其影響的藤丸決定再也不碰電腦,可是他還是不能組織自己和朋友九條音彌(佐藤健 飾)、高木遙(川島海荷 飾)被卷入到新的計劃當中。載有核彈的飛機正在一點點向東京逼近,而東京的群眾卻毫不知情,為了避免東京遭受到核彈的重創,藤丸和音彌不得不繼續開始奮戰。而他們所面對的除了老對手折原瑪雅(吉瀨美智子 飾)和神崎潤(成宮寬貴 飾)外,還有許多新人。而結果究竟如何呢?