1999年的東京，一部軍用的機(jī)械人在無人的情況自動啟動、一個名為帆場瑛一的篠原重工天才程序員自殺；誰也沒想到，兩起無關(guān)事件卻會在將來把東京帶入恐怖中。從建筑施工現(xiàn)場到人們的日常生活，處處都可以見到一種被稱為“Labor”的大型機(jī)器人。面對Labor相關(guān)犯罪與日俱增的局面，警察局成立了特殊車輛二課，配備專門機(jī)器人PatLabor，負(fù)責(zé)處理特殊事務(wù)。Labor到了更新?lián)Q代的時期，作為機(jī)器人大腦的電腦操作系統(tǒng)升級為HOS。正在這時，突然發(fā)生多起機(jī)器人失控事件，機(jī)動警察小隊負(fù)責(zé)調(diào)查此事。他們發(fā)現(xiàn)這是由與HOS有關(guān)的電腦病毒所導(dǎo)致的，而肇事者已經(jīng)銷毀了所有資料行蹤不明。在東京灣，制造巨型海上方舟以解決東京土地問題的巴比倫計劃已經(jīng)到了關(guān)鍵時刻，那里集結(jié)了全國45%的Labor機(jī)器人，這些機(jī)器人一旦失控后果將不堪設(shè)想……
　　本片為TV動畫《機(jī)動警察》的劇場版。