距離東京三百公里外的鳳凰島上，發生了一起人員被馬匹踩踏而死的事件，誰知卻讓杉下右京（水谷豐 飾）的老搭檔神戶尊（及川光博 飾）找上門來。原來這座私人小島正提供給有自衛隊背景的某民兵組織作為訓練基地，而該組織似乎涉嫌制造生化武器。神戶受警察廳次長甲斐峰秋（石坂浩二 飾）指派，命令杉下與搭檔甲斐享（成宮寬貴 飾）以調查命案的名義前往鳳凰島，暗中偵查生化武器的證據。特命系二人組在民兵組織負責人神室司（伊原剛志 飾）的引導下來到事故現場，而杉下則察覺到這起意外背后似乎有著某種人為的因素存在。　　當他和隨后趕來的伊丹（川原和久 飾）等人漸漸逼近事實真相時，心懷鬼胎的政要突然命令自衛隊對他們采取行動……