明萬歷年間,朝廷內憂外患不斷,古龍鎮上一家名為飛刀門的武館也由于戰亂而日漸蕭條,師父老李飛刀和兩個關門弟子--萬里風和牛大春,一起過著不問世事的平靜日子。好景不長,老李飛刀的結拜兄弟,起義軍領袖郭靖明將女兒郭盈盈托付給老李飛刀照顧,與此同時老李飛刀青梅竹馬的師妹,已被皇帝選為貴妃的牛婉君,也由于后宮斗爭,帶女兒芊芊和太監小順子到飛刀門避難。這些人同在一個屋檐下卻有著相反的立場,老李飛刀一邊努力化解雙方的隔閡,一邊又要保護師妹不受皇后爪牙的襲擊,牛貴妃在親歷了老李飛刀為自己所做的一切之后,與昔日的師兄再續前緣。二十年一度的華山論劍,郭靖明與朝廷的夏將軍雙雙前來,意欲借華山論劍之機拉攏武林中人為自己效力,中途卻傳來倭寇入侵的消息,起義軍與朝廷官兵盡棄前嫌,共御外敵,老李飛刀以盟主的身份組織武林人士協助官軍,朝廷表彰其功績,飛刀門被御封“武林第一門”。