磁星騎士描述的是在人類居住的五行洲之外，還有一個精靈的世界叫恒磁星。恒磁星的長老發現邪惡的紅騎士妄圖破壞兩個世界，于是向五行洲派出了磁星精靈遠征隊，尋找能夠拯救兩個世界的磁星騎士。沒想到，被選中的磁星騎士居然是散漫的阿峰、活在因事故死去的哥哥陰影中的向東、缺少父母陪伴的富家千金雅玲和從小失去雙親、性格孤僻懦弱的茉莉。這四個普通學生最初缺乏使命感，但在與邪惡分子的斗爭中，逐漸克服了各自的缺點，齊心協力獲得了勝利，成為了真正的磁星騎士。