上季Max為了摧毀基因庫，回到Manticore。遭遇幼年版的自己，被擊中心臟倒地，Zack捐出了自己的心臟挽回了Max的性命。
　　Manticore轉移到一個隱蔽的退伍軍人醫(yī)院，繼續(xù)做自己的研究和訓練，并開發(fā)出了X6，X7代轉基因人。
　　因為基因庫已被Max摧毀，所以需要X5通過最原始的Sex行為來繁殖下一代。指派給Max的性伙伴竟然是Ben的孿生兄弟，Max為其起名：Alec。
　　Max一直沒有放棄逃出Manticore，她從自己的房間挖了條通道到地下室，在地下室發(fā)現(xiàn)了X5之前的幾代轉基因人，因為融合了過多的動物基因，所以外表和人類相差較多。并且碰到最早被博士所制造出來的第一個狗人：Joshua，后來在Alec及Joshua的幫助下。Max逃出了 Manticore。
　　但是Manticore在Max身上下了種病毒，專門用來對付Logan的病毒，只要他們有身體接觸，Logan就會中毒身亡。解藥只有一支。解救過Logan之后，Max只能痛苦得和愛人保持一定距離。
　　同時，Manticore發(fā)現(xiàn)Max的基因組合是最完善沒有任何瑕疵的組合。有個神秘組織幾千年來通過正常生育手段來繁殖挑選優(yōu)秀的基因突變人。此組織某個成員脫離組織后，成立了Manticore，此人就是Joshua所說的“父親”。Max是他精心設計的特殊一人！
　　Max后來潛入了Manticore徹底摧毀了該機構，同時把地下室以及其他X1－X7全部釋放出來。
　　season2的故事這時候才真正地開始，Max如何與Logan在無法接觸中保持愛情？逃出的轉基因人如何在社會中生存？大家對非人形的轉基因人，象Joshua那樣的狗人是接受還是恐懼？神秘組織怎樣才能得到Max？“父親”在Max身上到底做過什么？？