革命歷228年,冬。從屬于E.U.聯盟聯軍的W Zero部隊中尉阿基德(入野自由 配音)迎來了與哥哥——布里塔利亞帝國圣米迦勒騎士團的團長信?修加?夏音度(松風雅也 配音)的決斗。成瀨幸也(松岡禎丞 配音)制造的炸彈雖然摧毀了帝國1/3的戰斗力,但是他們仍然面對著為數眾多的對手。敵我差距懸殊,獲勝希望渺茫。關鍵時刻,騎士團下的阿修羅隊隊長阿修雷?阿修羅(寺島拓篤 配音)臨陣倒戈,加入阿基德他們一方。決戰前夕,阿基德剪下自己的一撮頭發,交到蕾拉?瑪露卡爾(坂本真綾 配音)的手中。
歷經戰火的洗禮,他們之間的關系悄然發生著改變。希望還是絕望,前路迷茫……