長相可愛個性爽朗的獅堂光(椎名碧流 配音)、心思細膩溫柔高貴的大小姐龍崎海(吉田古奈美 配音)、智勇雙全成熟穩重的鳳凰寺風(笠原弘子 配音),命運讓這三名個性迥異的女孩相遇了,她們被選中成為了魔法騎士,前往瀕臨崩潰的錫菲羅,拯救那里的居民于水火之中。
支撐著錫菲羅的支柱是名叫艾美諾(緒方惠美 配音)的公主,她為了這個城市而生,為了這個城市而活,通過虔誠的祈禱,艾美諾保佑著錫菲羅。然而,艾美諾卻愛上了她的神官謝加圖(小杉十郎太 配音),因此而無法集中精神祈禱,錫菲羅因此而遇到了前所未有的危機,解決危機的方法只有一個,那就是殺掉艾美諾。